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关于种质资源论文范文写作 利用SRAP标记分析春兰种质资源遗传多样性相关论文写作资料

主题:种质资源论文写作 时间:2024-04-19

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摘 要:利用SRAP分子标记对42份春兰品种及1份多花兰、1份春剑及3份杂交兰进行遗传多样性分析.筛选出的15对引物组合共扩增出185个位点,其中多态性位点184个,平均每对引物组合产生12.27个多态性位点.引物组合Me8-Em16的Nei’s基因多样性数H(0.3993)、Shannon信息指数I值(0.5794)和有效等位基因数Ne(1.7280)都是最高值.47份材料的遗传相似系数变化范围为0.63~0.80,UPGMA聚类分析表明,在遗传相似系数为0.662处,将47份材料划分成5个类群.本研究较好地揭示了47份材料亲缘关系的远近,为春兰各品种间的分类和杂交亲本的选择提供重要理论依据.

关键词:春兰;SRAP;遗传多样性;聚类分析;亲缘关系

中图分类号:S311 文献标志码:A 论文编号:2013-1027

Genetic Diversity Analysis of Cymbidium goeringii "s Germplasm Resources Based on SRAP Markers

Niu Tian1, Zhang Lin2, Wang Houxin2, Li Chengxiu2, Nie Shuo1, Zhu Cuicui1, Wang Changxian2

(1College of Forestry, Shandong Agriculture University, Tai’an 271018, Shandong, China;

2Taishan Forestry Academe, Tai’an 271000, Shandong, China)

Abstract: SRAP was used to analyse the genetic diversity analysis of 42 Cymbidium goeringii cultivars and 1 specie of Cymbidium floribundum, 1 specie of Cymbidum longibracteatum and 3 species of hybrid Cymbidium. 15 polymorphic primer combinations were screened and a total of 185 DNA loci were amplified,184 of which were polymorphic. The average number of polymorphic DNA loci amplified by each primer was 12.27. Primer combination Me8-Em16’s Nei’s genetic diversity index (0.3993), Shannon"s information index (0.5794) and Effective number of alleles (1.7280) were the highest. The genetic similarity among 47 germplasm ranged from 0.63-0.80. The UPGMA clustering showed that all the tested cultivars and species were classified into five cluster groups with the similarity coeficient of 0.662. The study were well revealed the 47 materials genetic relatives. The findings of this study would provide an important theoretical basis for Cymbidium goeringii classification and parental selection in cross breeding.

Key words: Cymbidium goeringii; SRAP; Genetic Diversity; Cluster Analysis; Genetic Relationship

0 引言

春兰(Cymbidium goeringii)属于兰科(Orchidaceae)兰属(Cymbidium),别名朵朵香、草兰、草素、山花等,地生兰原种,室内观赏盆栽花卉.在中国江浙地区分布较广,福建、广东、四川、云南、安徽、江西、台湾等地亦有出产,有肉质根及球状的拟球茎,叶丛生而刚韧,狭长而尖,边缘粗糙;假鳞茎稍呈球形,叶4~6枚集生,狭带形,边缘有细锯齿;花单生,少数2朵,花葶直立,花期2—3月.兰花是中国十大传统名花之一,距今已有2500多年的栽培历史.其味清幽,花色淡雅,具有较高的观赏价值.

随着分子生物学技术的不断发展,DNA分子标记技术已经逐渐应用到春兰的鉴定中.目前应用于春兰分子标记的主要为RAPD、AFLP、ISSR等.季祥彪等[1]采用RAPD标记对贵州野生春兰遗传多样性进行分析;陈慧云等[2]利用AFLP分子标记对部分春兰名品进行了DNA指纹图谱分析;春兰ISSR-PCR反应体系的优化也已见报道[3].但SRAP(sequence-related amplified polymorphism,相关序列扩增多态性)是由Li等[4]开发的一种新型的PCR分子标记技术,它针对基因外显子里GC含量丰富而启动子和内含子里AT含量丰富的特点来设计引物进行扩增,因不同个体的内含子、启动子和间隔区长度不等而产生多态性,具有操作简便、稳定可靠、共显性高、重复性高、易于分离条带及测序的特点[5],在基因组中分布均匀,但是同样易受到反应条件和扩增程序变化的影响.目前SRAP主要应用于植物种质资源鉴定评价、种缘进化关系、遗传图谱构建、基因定位、重要性状标记以及比较基因组学等方面.目前关于利用SRAP分子标记进行遗传多样性分析的文章未见报道,本研究利用SRAP分子标记对42份春兰品种及1份多花兰、1份春剑及3份杂交兰进行遗传多样性分析,拟为春兰各品种间的分类和杂交亲本的选择提供理论依据.

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