刘雷生物医学信息学探路者,本论文为免费优秀的关于医学信息学论文范文资料，可用于相关论文写作参考。
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早上在位于徐家汇的复旦大学生物学研究院,中午在位于金山的上海市公共卫生临床中心,下午在位于张江的上海生物信息技术研究中心,复旦大学生物医学研究院研究员刘雷每天可能要奔波几十公里,所有的工作内容都围绕着一个主题——生物医学信息.
作为多年致力于生物医学信息学的科研工作者,刘雷站在时代的潮头,综合应用多门学科,在基因组数据的分析和挖掘、生物网络的构建和分析、生物系统的建模和模拟、医疗大数据整合和挖掘、临床决策支持、精准医学等方面做了大量工作,取得了一系列创新性成果.他用日复一日的勤奋和智慧,推动我国生物医学信息学向更高水平发展.
生物医学和计算机科学的双重人才
随着科学向综合性发展和大数据时代到来,各种交叉学科不断形成,生物医学信息学就是其中之一.
作为北京大学生物学系毕业的高材生,刘雷从一开始就选择了遗传学.后来,从中国科学院发育生物学研究所的硕士到美国康涅狄格大学分子和细胞生物学系的博士,刘雷在专业上日益精进,不断获得突破.当时,康涅狄格大学有一位生物系的老师,热衷研究分子进化,刘雷在他的影响下,对生物信息学产生了浓厚的兴趣.90年代,人类基因组计划正在轰轰烈烈地开展,生物信息学从中孕育而生.然而,生物信息学是一门交叉学科,融合了生物技术和计算机科学,这类复合型人才奇缺.刘雷抓住了这一契机,不顾别人疑惑的目光,毅然选择了到康涅狄格大学计算机系做博士后,从此成为兼备生物学和计算机技术的复合型人才.
1999年,博士后结束,由于刘雷既懂计算机又懂生物学,受聘于美国伊利诺伊大学香槟分校生物技术中心,组建生物信息学实验室并担任主任.在这里,刘雷进行服务器基础设施建设、基因组数据序列分析,还开课讲授生物信息的一些课程,各项工作顺利进行,成果迭出.“交叉学科存在语言的问题,你要听懂学计算机的人在说什么,也要听懂学生物的人在说什么.”在这种情况下,刘雷的双重学科背景为团队的沟通交流提供了便利,他一方面将生物学的问题转化成计算机的问题开展工作,一方面将计算机专用的算法和结果解释给生物学家们听,成为了不同学科之间沟通对话的桥梁.
为了适应交叉学科对不同专业人才的需求,生物信息学实验室招纳了计算机领域、生物领域、数学领域等不同领域的人才.刘雷在组建实验室的过程中对整个生物信息领域有了更加深切的了解,冥冥之中为他回国开展相关工作奠定了坚实的基础.
助力我国生物医学信息技术
2002年,上海生物信息技术研究中心成立,研究中心的两位负责人在去美国访问期间,和刘雷一见如故.应他们的邀请,刘雷从2003年开始担任上海生物信息技术研究中心客座研究员,逐渐和国内生物信息研究领域建立起广泛的交流和沟通.2007年,刘雷入选中科院“百人计划”正式回国,任中科院上海生命科学研究院系统生物学重点实验室研究员、上海生物信息技术研究中心副主任,用所学知识报效祖国.
面对数量大、内容层次复杂的医学证据,要想从中全面、系统、快速的获取最佳的医学知识和证据,就必须借助计算机巨大的存储和处理信息的能力.上世纪90年代之后,医疗信息化成为改进医疗服务质量、提高服务效率、把医疗卫生服务成本控制在民众可接受水平的主要技术手段.2010年,刘雷申请主持了国家高技术研究发展计划（“863”计划）项目“数字化医疗工程技术开发”中的第二课题“医学知识库和临床决策支持系统研发”,旨在为临床提供更为便捷和随需而得的医学知识和证据获取途径,促进医疗水平的提高.
在这一科研项目中,刘雷带领团队围绕医学知识库的构建和临床决策知识系统的研发,开展了医学知识库构建技术研究、数字化临床指南知识库和决策支持系统研发、数字化临床路径实现技术和应用模式研究、智能化合理用药系统研发、以及数字化人体仿真建模和辅助诊疗技术研究.
刘雷说：“现在医疗电子化程度已经很高了,有电子病例等各种系统,但是这些数据都是分散的,相互之间并不联通.我们想要建立一个数据中心,将分散的数据集中在一起,并整理成体系,以利于数据挖掘.”基于此,刘雷和团队研发了数字化临床指南知识库和决策支持系统.“当医生遇到一个难题,计算机的决策支持系统会将相关知识推送给他,省去了医生查阅文献的时间.”而对基层医生,知识库提供了一个医疗指南,“比如遇到高血压病人,系统会给基层医生提示,显示该做什么检查、开什么药,来辅助临床治疗”.
刘雷认为,数字化医疗不但在医学信息化、生物信息的发展过程中会起到重要作用,而且对构建和谐医患关系也大有裨益.“医患关系最大的问题是信息不对称.患者知道的很少,医生知道的很多,患者听不懂医生所说的专业术语.那么这时候还是沟通的问题,大家有误会就会造成医患关系紧张.”在刘雷看来,医学知识库和临床决策支持系统在给医生提供服务的同时,也应该给患者提供服务,要将医学知识库的知识进一步变得通俗易懂,让患者能够清楚了解.
曾经有医生不理解刘雷,“你们的工作难道要取代医生吗?”,他们认为,对患者解释医学知识只会浪费时间.刘雷解释说,“我是在帮你们,也是在帮助患者,让你们更好地沟通.只有这样工作才能更顺畅”.那么,如何让知识库更好地为患者服务呢?刘雷设想,现在中国的病人太多,排队等候时间很长,可以将患者排队等候的时间利用起来,将一些知识推送给患者,这样一来,患者对病况有所了解之后,再和医生沟通起来就会容易很多.
像马儿一样驰骋
如今,回国已有8年,刘雷说：“我做了正确的选择.”他目睹了2008年的北京奥运会,见证了2010年的上海世*,中国大地上的一派欣欣向荣之景令他倍受鼓舞.“在国内,我有自己的实验室,承担大数据项目、‘863’项目,最近又在做精准医疗.这让我站得更高,看得更远.”
精准医疗是个性化医疗的延伸,将促使医学进入智能时代,产生颠覆式医学创新.刘雷说,他不久前刚去天津做了题为“生物医学信息——从大数据到精准医疗”的报告,精准医疗研究已经成为各国科研和医疗机构以及企业界高度关注和大力投入的重要研究领域.据刘雷介绍,精准医疗是一个很庞大的项目,一是要做生物信息数据分析总结,二是做临床数据信息的采集分析,三是软件和产品的开发.最终,要实现从临床数据到样本、到分析、再到知识库和临床决策支持系统的整合.
如今,刘雷身任多职,学校、医院、研究院,他到处奔忙,乐此不疲.他笑着说：“我是属马的,奔跑是马儿的天性.”
而在刘雷的众多身份中,他最为看重的一个是教师.现在他带的学生既有中科院上海生命科学研究院的、又有复旦大学的,学生来自计算机、数学、生物、药学各个领域.在培养学生上,刘雷喜欢给学生独立自由的空间,他对学生说,“当你们博士毕业的时候就该成为某个领域的专家”,并经常鼓励他们发挥主观能动性,用智慧去克服难题.他觉得,自由的空间更能激发学生的想象力,而过于约束学生会让他们陷于被动.
人的一生有很多路可以走,刘雷对学生的未来十分宽容和乐观.“其实学生博士毕业以后还是可以有所选择的,并不是每一个人都必须要做科研.当发现自己不适合做科研的时候,完全可以选择其他的路.”刘雷用自身的经历,指引学生走进科研大门,让他们看到科研的精彩.
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